Ilmuwan NTU Singapura Menerbitkan Peta Plankton Lautan Dunia

Ilmuwan senior emeritus di CNRS, Daniel Vaulot, mengatakan, peta tersebut dapat membantu mempromosikan penelitian tentang komunitas plankton secara global.

"Para peneliti sekarang dapat menggunakan sumber daya ini untuk melihat distribusi global dan mempelajari ekologi plankton tertentu dengan percaya diri. Protista memainkan peran ekologis kunci dan terlibat dalam produktivitas primer, siklus nutrisi, dan penyerapan karbon," tambah Vaulot yang juga memimpin proyek tersebut.

Dia mengatakan sementara protista secara historis lebih sulit dipelajari karena ukurannya yang kecil, ledakan studi metabarcoding selama 10 tahun terakhir telah memperluas pengetahuan kita tentang organisme ini.

Metabarcoding adalah teknik molekuler yang digunakan untuk mengidentifikasi spesies organisme berdasarkan urutan DNA mereka.

"Gen tertentu bersifat 'universal'. Mereka dimiliki oleh semua individu dalam suatu kelompok tetapi bervariasi dari satu spesies ke spesies lain. Urutan ini digunakan sebagai "barcode" yang memungkinkan kita untuk mengetahui spesies mana yang dimiliki oleh DNA yang dianalisis, apakah itu hewan, tumbuhan , jamur atau protista," kata Vaulot.

Sementara pengurutan genetik untuk mengidentifikasi spesies biasanya memakan waktu, kemajuan dalam teknik molekuler dalam dekade terakhir telah memungkinkan para peneliti untuk menganalisis jutaan "barcode" dalam sampel tertentu sekaligus.

Dengan bantuan mahasiswa sarjana dan pascasarjana dari lab Geek, tim telah memasukkan data metabarcoding metaPR2 dari 59 studi yang tersedia, dan bertujuan untuk menambahkan lebih banyak secara perlahan, khususnya data dari lingkungan yang kurang dipelajari.

Memetakan semua plankton di lautan tetap menjadi usaha yang menantang.

Menunjuk ke garis ungu yang membentang di peta interaktif seperti bekas luka panjang, Clarence Sim dari lab Geek mengatakan, titik data berasal dari ekspedisi Tara, yang menyelesaikan pengambilan sampel plankton laut pertama di dunia dengan berlayar melintasi dunia.

Sementara upaya itu sangat mengesankan, kata Sim, upaya pengambilan sampel laut lainnya bersifat tambal sulam, dilakukan oleh para peneliti di daerah yang dapat diakses oleh mereka, dan tergantung pada dana yang tersedia.

Meskipun hal ini tidak menghambat para peneliti di Eropa, dengan Mediterania dan perairan lepas pantai Portugal telah diambil sampelnya secara substansial, hal yang sama tidak berlaku untuk wilayah lain di dunia.

"Lautan sangat luas, dan hampir tidak mungkin untuk mengumpulkan sampel dari setiap area... Kami masih kehilangan upaya seperti itu di lautan Asia Tenggara," kata Sim.

Menurut Sim, hanya dua sampel yang telah dikumpulkan dari wilayah tersebut, keduanya dari Singapura, dengan satu diambil dari pantai timur dan yang lainnya dari Kepulauan Selatan.