Varian Ketiga Virus Korona P.1 Telah Menyebar di 24 Negara

Hanya dalam hitungan minggu, dua varian virus korona menjadi begitu akrab sehingga Anda dapat mendengar nama alfanumeriknya, yang tidak dapat dipahami saat disiarkan oleh televisi.

Varian B.1.1.7, yang pertama kali diidentifikasi di Inggris, telah menunjukkan kemampuan untuk menyebar jauh dan cepat. Di Afrika Selatan, hasil mutasi yang disebut B.1.351 dapat lolos dari sistem antibodi manusia, dan mengalahkan keefektifan beberapa vaksin.

Para ilmuwan juga mengamati varian ketiga yang muncul di Brasil, yang disebut P.1. Sejak penemuannya pada akhir Desember, penelitian pada varian ini berjalan lebih lambat, membuat para ilmuwan tidak yakin seberapa banyak yang perlu dikhawatirkan.

"Saya menahan napas," kata ahli epidemiologi di Broad Institute, Bronwyn MacInnis.

Saat ini, tiga studi menawarkan sejarah yang menenangkan dari kenaikan meteorik P.1 di Kota Manaus di Amazon. Kemungkinan besar varian ini muncul di sana pada November dan kemudian memicu lonjakan kasus virus korona yang memecahkan rekor. Penelitian menemukan, P.1 mendominasi kasus-kasus di kota, sebagian karena penularan yang meningkat.

Tetapi, varian itu juga memiliki kemampuan untuk menginfeksi beberapa orang yang memiliki kekebalan dari serangan Covid-19 sebelumnya. Dan percobaan laboratorium menunjukkan bahwa P.1 dapat melemahkan efek perlindungan dari vaksin Tiongkok yang sekarang digunakan di Brasil.

Studi terbaru ini belum dipublikasikan di jurnal ilmiah. Penulis memperingatkan bahwa temuan mereka pada sel di laboratorium tidak selalu diterjemahkan ke dunia nyata, dan mereka baru mulai memahami perilaku P.1.

"Penemuan ini berlaku untuk Manaus, tapi saya tidak tahu apakah itu berlaku untuk tempat lain," kata ahli virologi di Imperial College London yang membantu memimpin banyak penelitian baru, Nuno Faria.

Dengan misteri yang tersisa di sekitar P.1, para ahli mengatakan virus itu adalah varian yang harus ditanggapi dengan serius.

"Memang benar untuk khawatir tentang P.1, dan data ini memberi kami alasannya," kata ahli epidemiologi dari Harvard TH, Sekolah Kesehatan Masyarakat Chan, William Hanage.

Sekarang, varian P.1 menyebar ke seluruh Brasil dan telah ditemukan di 24 negara lain. Di Amerika Serikat (AS), Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit telah mencatat enam kasus di lima negara bagian terkait virus ini, Alaska, Florida, Maryland, Minnesota, dan Oklahoma.

Masker dan Jarak Sosial

Untuk mengurangi risiko wabah P.1 dan infeksi ulang, Faria mengatakan penting untuk menggandakan setiap tindakan untuk memperlambat penyebaran virus korona. Masker dan jarak sosial dapat bekerja melawan P.1, dan vaksinasi dapat membantu menurunkan penularannya dan melindungi mereka yang terinfeksi dari penyakit parah.

"Pesan utamanya adalah Anda perlu meningkatkan semua upaya vaksinasi secepat mungkin. Anda harus selangkah lebih maju dari virus," katanya.

Faria dan rekan-rekannya mulai melacak virus korona ketika kasus meledak di Brasil musim semi lalu. Manaus, kota berpenduduk dua juta di kawasan Amazon, sangat terpukul. Pada puncak musim semi, pemakaman di Manaus dipenuhi oleh korban virus ini.

Tetapi, setelah mencapai puncaknya pada akhir April, Manaus tampaknya telah melewati pandemi terburuk. Beberapa ilmuwan mengira bahwa penurunan itu berarti Manaus telah memperoleh kekebalan kawanan.

Faria dan koleganya mencari antibodi virus korona dalam sampel dari bank darah Manaus pada Juni dan Oktober. Mereka menentukan bahwa sekitar tiga perempat penduduk Manaus telah terinfeksi.

Namun menjelang akhir tahun 2020, kasus baru mulai melonjak kembali.

"Kasus sebenarnya jauh lebih banyak dibandingkan puncak kasus sebelumnya, yang terjadi pada akhir April, dan itu sangat membingungkan kami," kata Faria.

Faria dan rekan-rekannya bertanya-tanya, apakah varian baru mungkin menjadi penyebab kebangkitan wabah. Di Inggris, para peneliti menemukan bahwa B.1.1.7 melonjak di seluruh negeri.

Untuk meneliti varian, Faria dan rekannya memulai upaya pengurutan genom baru di kota tersebut. Meskipun B.1.1.7 telah muncul di bagian lain Brasil, mereka tidak menemukannya di Manaus. Sebaliknya, mereka menemukan varian yang belum pernah dilihat orang sebelumnya.

Banyak varian dalam sampel mereka berbagi 21 mutasi yang tidak terlihat pada virus lain yang beredar di Brasil.

"Saya rasa saya melihat sesuatu yang sangat aneh, dan saya cukup khawatir tentang ini," ujar Faria.

Beberapa mutasi khususnya membuatnya khawatir, karena para ilmuwan telah menemukannya di B.1.1.7 atau B.1.351. Eksperimen menunjukkan bahwa beberapa mutasi mungkin membuat varian baru lebih mampu menginfeksi sel. Mutasi lain memungkinkan mereka menghindari antibodi dari infeksi sebelumnya atau yang dihasilkan oleh vaksin.

Saat Faria dan rekannya menganalisis hasil mereka, para peneliti di Jepang membuat penemuan serupa. Empat turis yang pulang dari perjalanan ke Amazon pada 4 Januari dinyatakan positif mengidap virus korona. Pengurutan genom mengungkapkan serangkaian mutasi yang sama yang dilihat Faria dan rekan-rekannya di Brasil.

Faria dan rekannya mengunggah deskripsi P.1 di forum virologi online pada 12 Januari. Mereka kemudian menyelidiki mengapa P.1 begitu umum. Mutasi mungkin membuatnya lebih menular, atau mungkin beruntung. Secara kebetulan, varian tersebut mungkin muncul di Manaus tepat saat kota menjadi lebih longgar dalam tindakan kesehatan masyarakat.

Infeksi Ulang

Mungkin juga P.1 menjadi umum karena dapat menginfeksi kembali orang. Biasanya, infeksi ulang virus korona jarang terjadi, karena antibodi yang diproduksi oleh tubuh setelah infeksi kuat selama berbulan-bulan. Tapi, ada kemungkinan bahwa P.1 membawa mutasi yang mempersulit antibodi tersebut untuk menempel padanya, memungkinkannya untuk menyelinap ke dalam sel dan menyebabkan infeksi baru.

Para peneliti menguji kemungkinan ini dengan melacak P.1 dari sampel paling awal pada Desember. Pada awal Januari, varian itu membuat 87 persen sampel. Pada bulan Februari, semua itu telah diambil alih sepenuhnya.

Menggabungkan data dari genom, antibodi, dan catatan medis di Manaus, para peneliti menyimpulkan bahwa P.1 menaklukkan kota itu bukan berkat keberuntungan, tetapi karena biologi: mutasinya membantunya menyebar. Seperti B.1.1.7, rata-rata dapat menginfeksi lebih banyak orang daripada varian lain. Mereka memperkirakan varian itu di suatu tempat antara 1,4 dan 2,2 kali lebih mudah ditularkan daripada garis keturunan lain dari virus korona.

Terapi varian itu juga mendapat keuntungan dari mutasi yang memungkinkannya lolos dari antibodi dari virus korona lain. Mereka memperkirakan bahwa dari 100 orang yang terinfeksi di Manaus tahun lalu, antara 25 dan 61 di antaranya mungkin telah terinfeksi ulang oleh P.1.

Para peneliti menemukan dukungan untuk kesimpulan ini dalam percobaan di mana mereka mencampurkan virus P.1 dengan antibodi dari Brasil yang menderita Covid-19 tahun lalu. Mereka menemukan bahwa efektivitas antibodi mereka turun enam kali lipat terhadap P.1 dibandingkan dengan virus korona lainnya. Penurunan tersebut mungkin berarti bahwa setidaknya beberapa orang akan rentan terhadap infeksi baru dari P.1.

"Tampaknya semakin banyak bukti yang menunjukkan bahwa sebagian besar kasus yang terkait dengan gelombang kedua memang semacam infeksi ulang," kata Faria.

Saat ini, Faria dan peneliti lain tengah mencari di seluruh Brasil untuk mengamati penyebaran P.1. Ahli penyakit menular di Fakultas Kedokteran Universitas São Paulo, Ester Sabino, mengatakan bahwa salah satu wabah baru muncul di Araraquara, sebuah kota di Brasil dengan 223.000 orang yang tidak memiliki tingkat Covid-19 yang tinggi sebelum P.1 muncul.

"Jika orang di Araraquara tidak memiliki tingkat antibodi yang tinggi sebelum kedatangan P.1, itu menunjukkan bahwa varian tersebut mungkin dapat menyebar di tempat-tempat tanpa sejarah ekstrim Manaus. Ini mungkin terjadi di tempat lain," katanya.

Ahli virologi di University of Arizona yang tidak terlibat dalam penelitian tersebut, Michael Worobey, mengatakan sudah waktunya untuk mewaspdai kemunculan P.1 di AS. Dia berharap varian ini akan menjadi lebih umum di AS, meskipun harus bersaing dengan B.1.1.7, yang mungkin segera menjadi varian utama di banyak negara.

"Paling tidak, itu akan menjadi salah satu pesaing," kata Worobey.

Dalam percobaannya, Faria dan rekannya juga menguji antibodi dari delapan orang yang menerima CoronaVac, vaksin buatan Tiongkok yang telah digunakan di Brasil. Mereka menemukan bahwa antibodi yang dihasilkan oleh vaksin kurang efektif dalam menghentikan varian P.1. n SB/newyorktimes/P-4