Komputasi AI Perpendek Pengurutan DNA Hanya Butuh Waktu 5 Jam

STANFORD - Tim peneliti yang dipimpin Universitas Stanford, baru-baru ini. berhasil meraih Rekor Dunia Guinness untuk teknik pengurutan DNA tercepat menggunakan komputasi kecerdasan buatan atau Artificial Intelligence (AI), untuk mempercepat alur kerja.

Penelitian yang dipimpin pakar kedokteran, genetika dan ilmu data biomedis di Stanford School of Medicine, Euan Ashley, bekerja sama dengan Nvidia, Oxford Nanopore Technologies, Google, Baylor College of Medicine, dan University of California, berhasil mencapai pengurutan DNA hanya dalam waktu singkat,5 jam 2 menit.

Studi yang dipublikasikan di The New England Journal of Medicine, melibatkan percepatan setiap langkah alur kerja pengurutan genom dengan mengandalkan teknologi baru. Ini termasuk menggunakan teknologo pengurutan nanopore pada PromethION Flow Cells Oxford Nanopore untuk menghasilkan lebih dari 100 gigabase data per jam, dan GPU Nvidia di Google Cloud untuk mempercepat panggilan dasar dan proses panggilan varian.

"Kami harus benar-benar memikirkan kembali dan mengubah jalur pipa data dan sistem penyimpanan kami," kata Ashley, baru-baru ini.

Para peneliti juga mengandalkan kerangka kerja aplikasi komputasi genomik Nvidia Clara Parabricks untuk mempercepat diagnosis genom.
Halaman Selanjutnya....